【最新版】中部地方のフリースクール助成金・補助金一覧｜不登校の利用料を抑える自治体まとめ

※本記事の内容・金額は、2025年11月時点で各自治体のホームページを確認した情報をもとにしています。最新情報は必ず各自治体の公式サイトでご確認ください。

中部地方でフリースクールの助成金・補助金を探している保護者の方へ

不登校のお子さんを支援するためにフリースクールを利用する際、気になるのが「利用料」です。
フリースクールの費用は、公立学校と違い基本的には自己負担。通所型であれば交通費もかかり、家庭の経済的負担は決して小さくありません。

一方で、自治体によってはフリースクールの利用料や交通費を補助する「助成金・補助金制度」が整いつつあります。ただし、制度の有無や対象、金額は自治体ごとに大きく異なり、「自分の住んでいる地域ではどうなのか？」がとても分かりにくいのが現状です。

そこで本記事では、中部地方（愛知・新潟・長野・富山・山梨）を対象に、保護者が利用できるフリースクール助成金・補助金情報を一覧で整理しました。
「フリースクール　助成金（補助金）」「フリースクール　補助」「不登校　利用料」などで検索している方の、情報収集の手間を少しでも減らせればうれしいです。

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フリースクールの利用料金と、助成金が必要な理由

フリースクールの利用料の相場は、地域や内容にもよりますが、通所型で月額3万〜7万円前後、オンライン型でも月1万〜3万円程度かかることが多いです。

さらに、通所型の場合は交通費、昼食費、教材費、イベント費などもかかるため、トータルの負担が大きくなりがちです。
そのため、自治体が行う「フリースクール補助」「フリースクール等利用支援」といった助成制度は、

• 不登校のお子さんが、自分に合った学びの場を確保し続けること
• 保護者の「不登校　利用料」負担を軽くすること

の両面で、とても重要な役割を果たしています。

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【最新版】中部地方のフリースクール助成金・補助金一覧

ここでは、中部地方のうち、実際にフリースクールの利用料や通所に対する助成金・補助金制度が確認できた自治体をまとめています。
各自治体ごとの「対象」「金額のイメージ」「リンク」を一覧からチェックできます。

※補助金額は「上限額」や「何割を補助」など自治体ごとに細かな条件があります。あくまで目安として記載し、詳細は必ず公式HPをご覧ください。

▼ 愛知県

自治体	制度名	対象者	補助内容	補助金額（目安）	リンク
豊田市	フリースクール等利用支援補助金	市内小・中・特別支援学校に在籍する不登校児童生徒の保護者 等	フリースクール等の利用料・教材費・行事費などの一部を補助	児童生徒1人あたり月額上限2万円	公式HP
大府市	フリースクール等授業料補助金	大府市立小中学校に在籍し、長期欠席傾向にある児童生徒の保護者	フリースクール等に支払った授業料の一部を補助	授業料の2分の1（ 児童生徒1人につき月2万円が上限）	公式HP
みよし市	フリースクール通所にかかる交通費補助	不登校等によりフリースクール等へ通う児童生徒	フリースクール通所にかかる交通費の一部を補助	交通費の一部（上限・回数などの条件あり）	公式HP

▼ 新潟県

自治体	制度名	対象者	補助内容	補助金額（目安）	リンク
上越市	上越市フリースクール等利用支援補助金	市内の不登校状態にある小・中学生の保護者（所得要件あり）	入学費・寮費・学習費・食費など、フリースクール利用にかかる経費の一部を補助	利用開始時の入学費・入寮費、 学習費・寮費・食費などについて 負担額の1/2を補助（ 学習費は月2万円前後を上限とする区分あり）	公式HP

▼ 長野県

自治体	制度名	対象者	補助内容	補助金額（目安）	リンク
長野市	フリースクール等民間施設利用料助成事業	市内に住所があり、不登校状態にある児童生徒の保護者	フリースクール等民間施設の利用料の一部を助成	利用料の一部（年額・月額の上限あり）	公式HP
松本市	フリースクール等利用児童生徒支援事業補助金	フリースクール等に通う不登校児童生徒の保護者	フリースクール等の利用にかかる経費を補助	利用料の一部（上限額・対象経費に制限あり）	公式HP
諏訪市	フリースクール等にお通いの児童生徒のご家庭への補助制度	フリースクール等に通う児童生徒のいる家庭	フリースクール等の利用料の一部を補助	利用料の一部（世帯要件・上限あり）	公式HP
下諏訪町	フリースクール等利用児童生徒支援補助金	町内在住の不登校児童生徒	フリースクール等の利用料の一部を補助	利用料の一部（上限・期間に制限あり）	公式HP
高森町	フリースクール利用料補助金	町内在住の不登校児童生徒の保護者	フリースクールの利用料を補助	利用料の一部（児童生徒1人あたりの上限設定あり）	公式HP
野沢温泉村	フリースクール利用料等補助金	村内在住の不登校児童生徒	利用料や通所にかかる経費等の一部を補助	利用料・通所費用の一部（上限額あり）	公式HP

▼ 富山県

自治体	制度名	対象者	補助内容	補助金額（目安）	リンク
富山県	フリースクール等通所児童生徒支援事業	県内の学校に在籍し、フリースクール等を利用する児童生徒	フリースクール等で活動するために必要な経費（通所・オンライン利用を含む）の一部を補助	利用内容に応じて実費の一部を補助（詳細は事業概要・要綱で確認）	公式HP

※富山県は、オンラインでの利用も対象となる点が特徴です。

▼ 山梨県

自治体	制度名	対象者	補助内容	補助金額（目安）	リンク
甲府市	甲府市フリースクール利用支援事業費補助金	市内在住の不登校児童生徒	フリースクール通所費用の一部を補助	利用料の一部（児童生徒1人あたりの月3万円が上限）	公式HP
北杜市	フリースクール利用支援補助金	市内に住所のある児童生徒	フリースクール等の利用料の一部を補助	利用料の一部（年額・児童生徒1人あたりの月3万円が上限）	公式HP

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フリースクール助成金の注意点・よくある質問

● 所得制限はある？

自治体によっては、生活保護世帯や就学援助世帯など所得制限が設定されているケースがあります。
「誰でも利用できる」のか、「一定の所得以下が対象なのか」は、必ずチェックしましょう。

● 通所要件がある自治体に注意

多くの自治体では、「通所型フリースクール」が対象となっています。
オンラインのみの利用では対象外となる場合もあるため、「通所日数」「出席扱いの要件」なども含めて確認が必要です。

● オンラインでも補助の対象になる自治体は？

富山県のように、オンライン学習やオンラインでの活動も補助対象に含まれる自治体が出てきています。
自宅からの参加や、遠方のフリースクールにつながりたいご家庭にとって、心強い制度です。

● いつ申請すればいい？

多くの自治体では、「利用開始前」または「年度の初め」に申請が必要です。
さかのぼっての申請ができないケースも多いため、フリースクールを検討し始めた段階で、早めに教育委員会や学校に相談することをおすすめします。

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まとめ：助成金を活用しながら、お子さんに合った学びを

フリースクールの助成金・補助金制度は、中部地方でも少しずつ広がりつつあります。
ただし、自治体によって

• 対象となるフリースクールの条件（通所型のみ／オンラインも可 など）
• 補助金額（例：月額上限2万円など）
• 所得条件・在住要件・申請期限

が大きく異なるため、「住んでいる自治体でどこまでサポートが受けられるか」を知ることがとても大切です。

一方で、「通所型」であることが条件の自治体も多くあります。

NIJINアカデミーは全国各地でリアル校（通所型の校舎）を開校しているため、
「通所型フリースクール」が要件となっている自治体の補助金でも、条件を満たせるケースがあります。

さらに、オンラインでも学べるコースがあるため、富山県のようにオンライン利用にも助成金が出る自治体との相性も良い形です。

「うちの地域の制度で、どんな利用の仕方ができそうか」「通所とオンラインをどう組み合わせるか」など、
具体的なイメージを持つためにも、まずは一度体験会で雰囲気を感じてみてください。